Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 PSG6-201ENST00000187910 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 HSPD1P10-201ENST00000404829 1676 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms