Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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SIX1Q15475 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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SIX1Q15475 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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SIX1Q15475 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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SIX1Q15475 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SIX1Q15475 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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