Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 OR4C1P-201ENST00000530880 937 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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BNIP1Q12981 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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BNIP1Q12981 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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BNIP1Q12981 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BNIP1Q12981 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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