Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB23Q9ULC3 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms