Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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SYNE4Q8N205 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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SYNE4Q8N205 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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SYNE4Q8N205 TOM1L1-220ENST00000575333 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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SYNE4Q8N205 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SYNE4Q8N205 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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