Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC094105.1-201ENST00000509745 560 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LINC02457-201ENST00000552992 596 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
IFT88Q13099 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms