Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CLIP4Q8N3C7 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CLIP4Q8N3C7 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CLIP4Q8N3C7 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CLIP4Q8N3C7 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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CLIP4Q8N3C7 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CLIP4Q8N3C7 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CLIP4Q8N3C7 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CLIP4Q8N3C7 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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