Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087292.1-201ENST00000573371 512 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003087.1-201ENST00000412828 499 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 OR52S1P-201ENST00000427016 937 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP242-201ENST00000515967 289 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC044839.3-201ENST00000532068 860 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ARL2-SNX15V9GYD0 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms