Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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HOXD13P35453 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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HOXD13P35453 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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HOXD13P35453 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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HOXD13P35453 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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HOXD13P35453 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
HOXD13P35453 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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