Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms