Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.32
CHRNEQ04844 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RNA5SP238-201ENST00000365464 120 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC020983.1-201ENST00000417063 543 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL050320.1-201ENST00000420044 446 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC00160-201ENST00000430635 693 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 HSD17B3-AS1-201ENST00000448857 1072 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC078788.2-201ENST00000462300 382 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RN7SL251P-201ENST00000464175 297 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC009269.1-201ENST00000470368 833 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR7E83P-201ENST00000511021 970 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RN7SL25P-201ENST00000583862 260 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 uc_338.21-201ENST00000622458 147 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 EEF1A1P22-201ENST00000559385 1380 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms