Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Stxbp4Q9WV89 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms