Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skp1Q9WTX5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms