Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trpc2Q9R244 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc2Q9R244 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms