Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Psma4Q9R1P0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms