Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Htra1Q9R118 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Htra1Q9R118 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms