Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Npas3Q9QZQ0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms