Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndrg3Q9QYF9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndrg3Q9QYF9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms