Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms