Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trpc4apQ9JLV2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trpc4apQ9JLV2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms