Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms