Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc28a3Q9ERH8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Slc28a3Q9ERH8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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Slc28a3Q9ERH8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Slc28a3Q9ERH8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Slc28a3Q9ERH8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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