Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Clstn2Q9ER65 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clstn2Q9ER65 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms