Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stx12Q9ER00 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stx12Q9ER00 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms