Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms