Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9DA42 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9DA42 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9DA42 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DA42 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9DA42 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9DA42 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms