Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc91Q9D8L5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc91Q9D8L5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms