Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifi35Q9D8C4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifi35Q9D8C4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms