Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Trappc6bQ9D289 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Trappc6bQ9D289 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Trappc6bQ9D289 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trappc6bQ9D289 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trappc6bQ9D289 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trappc6bQ9D289 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Trappc6bQ9D289 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Trappc6bQ9D289 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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