Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Batf3Q9D275 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Batf3Q9D275 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms