Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snu13Q9D0T1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snu13Q9D0T1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms