Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spc24Q9D083 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spc24Q9D083 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms