Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snf8Q9CZ28 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snf8Q9CZ28 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms