Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mis12Q9CY25 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms