Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms