Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud1Q9CUB6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms