Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Lhfpl3Q9CTN8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lhfpl3Q9CTN8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms