Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ankrd1Q9CR42 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms