Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl28Q9CR40 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Klhl28Q9CR40 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms