Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atg12Q9CQY1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms