Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
PompQ9CQT5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PompQ9CQT5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PompQ9CQT5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PompQ9CQT5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PompQ9CQT5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PompQ9CQT5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PompQ9CQT5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PompQ9CQT5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PompQ9CQT5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms