Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4921530L21RikQ9CQ47 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921530L21RikQ9CQ47 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms