Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rwdd2bQ99M03 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rwdd2bQ99M03 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms