Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prpf19Q99KP6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prpf19Q99KP6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms