Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ5

Tcf19, Transcription factor 19-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf19Q99KJ5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tcf19Q99KJ5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms