Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ophn1Q99J31 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ophn1Q99J31 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms