Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tubb6Q922F4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tubb6Q922F4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms