Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx4Q91YJ2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms