Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna2Q91X60 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna2Q91X60 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms