Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Srsf4Q8VE97 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf4Q8VE97 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Srsf4Q8VE97 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms